Покровская церковь существовала в Сарапуле с начала XVIII века. После обветшания и двух пожаров, бывшая деревянная церковь на средства прихожан в 1791 году вновь отстраивается из камня. Основные средства поступили от Сарапульского купца III гильдии Вечтомова Степана Ивановича.
В Покровской церкви существовало 3 престола – в честь Святого Николая Чудотворца (правый), в честь Святых мучеников Флора и Лавра (левый), в честь Покрова Пресвятой Богородицы (главный). Отсюда и старые названия близлежащих улиц – улица Большая Покровская (ул. Труда), улица Малая Покровская (ул. Ст. Разина), улица Никольская (ул. Интернациональная). К приходу Покровской церкви относились жители дд. Усть-Сарапулки, Непряхи, Подгоры, Костино, Сигаево, Мельниково, Лубянки.
В 1813 году началось строительство каменной колокольни в нижнем ярусе которой устроен храм в честь Святых Апостолов Петра и Павла — Петропавловская церковь. В строительстве принимали участие пленные французы размещенные в Сарапуле после Отечественной войны 1812 года.
Покровская церковь была обладательницей самого большого в городе колокола весом 600 пудов он был отлит в Сарапуле на колокольном заводе Рябинина в 1901 году.
В 1902 году храм и колокольню отремонтировали на средства которые выделил Сарапульского I гильдии купец Смагин Николай Васильевич и его жена Анна Васильевна. В 1905 году на их же средства Петропавловскую церковь расширили и пристроили трапезный храм с двумя боковыми приделами – в честь Преподобного Серафима Саровского и в честь Сретения Господня.
В 1902 — 1905 г. на средства купца Н. В. Смагина между Покровской и Петропавловской церквами в память выздоровления Государя Императора Николая II от болезни была построена каменная Никольская часовня.
К Покровской церкви была приписана домовая Церковь Святой Анны Пророчицы при приюте на улице Иерусалимской.
В годы Гражданской войны церковь сильно пострадала от обстрелов с левого берега Камы.
Церковь была закрыта в 1932 году по распоряжению Удмуртского облисполкома.
Здание переоборудовано в хлебопекарню.
В конце XX века при приватизации Сарапульского хлебокомбината храмовой комплекс был передан Русской Православной Церкви.
В 2010-12 годы проводились реставрационные работы финансируемые ОАО НК «Русснефть». В церемонии открытия 11 октября 2012 года одного из главных православных Удмуртии приняли участие Митрополит Ижевский и Удмуртский Николай, Президент Удмуртской Республики Александр Волков и президент ОАО НК «РуссНефть» Михаил Гуцериев.
В 2014 году начались росписи внутренних интерьеров собора на средства В.А. Уланова.
Памятник регионального значения Удмуртской Республики.
Историческую справку подготовил Ерастов Виктор Сергеевич
Фотограф Игорь Катков
